Документ: Письмо Минфина России от 05.05.2022 N 02-06-10/41648

Возвращать остаток субсидии по итогам года закон обязывает только в ситуации, когда не выполнили количественные или качественные показатели задания. В противном случае эти деньги используют на цели, ради которых учреждение создано. Это касается и поступлений от дебиторской задолженности прошлых лет.
Если задание выполнили, перечисление в бюджет станет добровольным и безвозмездным. Такую операцию можно провести только за счет собственных средств учреждения.
Данного подхода ведомство придерживается давно. Оно также рекомендовало учредителям проанализировать причины появления остатков и, если нужно, принять управленческие решения.
Отметим, контролеры могут требовать от учреждения возместить ущерб бюджету, например, при нецелевом использовании средств.

Документ в СПС КонсультантПлюс